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Hyper MPI是什么

2020-11-05 16:17:48

Hyper MPI是整個(gè)高性能計(jì)算解決方案的關(guān)鍵組件，它實(shí)現(xiàn)了并行計(jì)算的網(wǎng)絡(luò)通訊功能，可以用來支持制造、氣象、超算中心等應(yīng)用場景，同時(shí)該通訊庫也可擴(kuò)展應(yīng)用于AI、 大數(shù)據(jù) 等通用領(lǐng)域。

BWA是什么意思

2020-11-05 15:29:33

BWA是用于將低分叉序列比對到大的參考基因組比如人基因組的軟件包。BWA主要是由三種算法組成：BWA-backtrack、BWA-SW和BWA-MEM

BLAST是什么

2020-11-05 14:47:43

BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白質(zhì) 數(shù)據(jù)庫 或DNA數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行相似性比較的分析工具。BLAST程序能迅速與公開數(shù)據(jù)庫進(jìn)行相似性序列比較。BLAST結(jié)果中的得分是一種對相似性的統(tǒng)計(jì)說明。

Wtdbg2是什么

2020-11-05 11:29:41

Wtdbg2是一個(gè)三代測序數(shù)據(jù)（同時(shí)適用于pacbio和nanopore）denovo組裝軟件，它是一款基于C語言開發(fā)的開源軟件。

smartdenovo是什么

2020-11-05 11:04:16

smartdenovo是一個(gè)同時(shí)適用于pacbio和nanopore測序數(shù)據(jù)的denovo組裝軟件，它是一款基于C語言開發(fā)的開源軟件。

PostgreSQL

2020-11-05 10:51:19

PostgreSQL是一種特性非常齊全的自由軟件的對象-關(guān)系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)（ORDBMS），它支持大部分的SQL標(biāo)準(zhǔn)并且提供了很多其他現(xiàn)代特性，如復(fù)雜查詢、外鍵、觸發(fā)器、視圖、事務(wù)完整性、多版本并發(fā)控制等。同樣，PostgreSQL也可以用許多方法擴(kuò)展，例如通過增加新的數(shù)據(jù)類型、函數(shù)、操作符、聚集函數(shù)、索引方法、過程語言等。它廣泛應(yīng)用在企業(yè)數(shù)據(jù)庫、Web建站和APP， 數(shù)據(jù)倉庫 和大數(shù)據(jù)、含 LBS 的導(dǎo)航應(yīng)用中。

數(shù)據(jù)庫遷移

2020-11-05 10:49:28

數(shù)據(jù)庫遷移 即將某數(shù)據(jù)源庫中的數(shù)據(jù)移動(dòng)到另一數(shù)據(jù)庫之間的操作。主要分為熱 遷移 和冷遷移。熱遷移是將內(nèi)存數(shù)據(jù)和硬盤數(shù)據(jù)同步進(jìn)行遷移。它對用戶業(yè)務(wù)的影響非常小。熱遷移過程是對數(shù)據(jù)庫中的內(nèi)存數(shù)據(jù)進(jìn)行遷移，用戶業(yè)務(wù)應(yīng)用對其是無感知的。而缺點(diǎn)是熱遷移的過程不可中斷，整個(gè)操作過程相對復(fù)雜。冷遷移即關(guān)機(jī)遷移。操作簡單，一般為 自動(dòng)化 操作。其缺點(diǎn)是不支持內(nèi)存數(shù)據(jù)的保存，容易導(dǎo)致內(nèi)存數(shù)據(jù)的丟失。

數(shù)據(jù)庫審計(jì)

2020-11-05 10:45:26

數(shù)據(jù)庫審計(jì)（簡稱DBAudit）能夠?qū)崟r(shí)記錄網(wǎng)絡(luò)上的數(shù)據(jù)庫活動(dòng)，它是一種對數(shù)據(jù)庫操作進(jìn)行細(xì)粒度審計(jì)的合規(guī)性管理，它可以對數(shù)據(jù)庫遭受到的風(fēng)險(xiǎn)行為進(jìn)行告警，對攻擊行為進(jìn)行阻斷。

racon是什么

2020-11-05 10:39:27

racon是一款在Github上發(fā)布的C++開源軟件，用于對一些不產(chǎn)生consensus的快速組裝軟件組裝得到的原始contig序列的糾錯(cuò)，生成基因組一致性序列，同時(shí)支持Pacbio和Oxford Nanopore測序數(shù)據(jù)。

MySQL

2020-11-05 10:38:56

MySQL是一種關(guān)系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)，它將數(shù)據(jù)保存在不同的表中，而不是放在一個(gè)大倉庫內(nèi)，增加了訪問速度并提高了靈活性。MySQL所使用的 SQL 語言是用于訪問數(shù)據(jù)庫的最常用標(biāo)準(zhǔn)化語言。MySQL軟件分為社區(qū)版和商業(yè)版，由于其體積小、速度快、成本低、開放源碼等特點(diǎn)，受到廣大中小型網(wǎng)站開發(fā)者的喜愛。MySQL 是目前最流行的開源型關(guān)系數(shù)據(jù)庫，大多應(yīng)用于互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)。例如：網(wǎng)站系統(tǒng)、日志記錄系統(tǒng)、數(shù)據(jù)倉庫系統(tǒng)等。

Minimap2是什么

2020-11-05 10:07:19

Minimap2是一種??多功能序列比對程序，可將DNA或mRNA序列與大型參考數(shù)據(jù)庫對齊。

什么是Miniasm

2020-11-05 10:01:08

Miniasm是由李恒開發(fā)，適合于小基因組及重復(fù)序列比例低的基因組組裝，相對于Canu和Falcon軟件，Miniasm組裝速度非常快。

ROMs是什么

2020-11-05 09:55:45

ROMs（Regional Ocean Modeling System）是海洋研究機(jī)構(gòu)常用的區(qū)域和大洋環(huán)流模式，已經(jīng)在CO-OPS開始得到大量使用，并且將其列為業(yè)務(wù)化海洋模式之一。R OMS 模式采用F90/F95編寫，代碼結(jié)構(gòu)依據(jù)網(wǎng)格特點(diǎn)編寫，支持共享存儲和消息傳遞兩種多處理器體系架構(gòu)，其對集群性能要求較高，具有計(jì)算密集、IO讀寫量較大、網(wǎng)絡(luò)延遲帶寬要求高的特點(diǎn)。

什么是FVCOM

2020-11-05 09:40:36

FVCOM是無結(jié)構(gòu)三角形網(wǎng)格架構(gòu)、有限體積、自由表面、三維原始方程海洋數(shù)值模型，包含了多種物理、水質(zhì)、生態(tài)計(jì)算模塊。FVCOM模型輸入輸出基于標(biāo)準(zhǔn)化NETCDF格式，具有平臺通用兼容性，并能使用VISIT可視化軟件是輸入輸出結(jié)構(gòu)進(jìn)行快速二維/三維可視化。

CMAQ是什么

2020-11-05 09:31:54

CMAQ（Community Multiscale Air Quality通用多尺度空氣質(zhì)量）模型，是美國環(huán)保局開發(fā)的第三代空氣質(zhì)量預(yù)報(bào)和評估系統(tǒng)（Models-3）的核心組成之一

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