Minimap2是什么

簡介

Minimap2是一種多功能序列比對(duì)程序,可將DNA或mRNA序列與大型參考 數(shù)據(jù)庫 對(duì)齊。

配置流程

1.配置編譯環(huán)境

1)安裝wget工具。

yum install wget-y

2)安裝Minimap2依賴庫和工具。

yum install-y git gcc-c++zlib-y

----結(jié)束

2.獲取源碼

獲取“minimap2”源碼包。

cd/usr/local/src
git clone https://github.com/lh3/minimap2

3.編譯和安裝

編譯Minimap2。

由于鯤鵬是兼容ARM v8 64位指令集,因此編譯方式如下:

cd minimap2/
make arm_neon=1 aarch64=1

4.運(yùn)行和驗(yàn)證

查看minimap2的版本信息。

cd/usr/local/src/minimap2
./minimap2--v

回顯內(nèi)容如下,表示編譯正常。

2.17-r954-dirty