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- 基因測序 內(nèi)容精選 換一換
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時間：2020-11-04 16:24:00 簡介 bedtools實用程序是用于處理基因組信息分析的強大工具集合。例如，bedtools允許人們以廣泛使用的基因組文件格式（ 例如BAM，BED，GFF/ GTF，VCF）與多個文件中的基因組間隔相交，合并，計數(shù)，互補和混洗。雖然每個工具都設(shè)計為執(zhí)行相對來自：百科
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大數(shù)據(jù)分析 云計算 基礎(chǔ)的公有云大數(shù)據(jù)服務(wù)較難充分滿足物聯(lián)網(wǎng)數(shù)據(jù)分析的要求原因包含： 1. 缺乏最佳實踐，學(xué)習(xí)成本/開發(fā)門檻高； 2. 缺少物聯(lián)網(wǎng)基因，影響IoT開發(fā)效率； 3. 功能分布零散，開發(fā)體驗差。 文中課程 ????????更多課程、微認證、沙箱實驗盡在華為云學(xué)院????? 基來自：百科生產(chǎn)環(huán)境的版本一致性，降低日常上線過程中版本管理的難度 立刻3購買 華大基因 將基因測序和容器技術(shù)完美結(jié)合，幫助華大更好地解決新一代基因測序技術(shù)在應(yīng)用過程中所產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)存儲、識別、計算等問題，在基因測序業(yè)務(wù)中，使多個步驟效率能提升近30%，大大縮短了項目的交付周期 立刻3購買來自：解決方案
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什么是Miniasm 什么是Miniasm 時間：2020-11-05 10:01:08 簡介 Miniasm是由李恒開發(fā)，適合于小基因組及重復(fù)序列比例低的基因組組裝，相對于Canu和Falcon軟件，Miniasm組裝速度非?？?。建議通過git下載最新版本。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境來自：百科![]()
來自：專題![]()
每個獨立的處理任務(wù)都配有專用的芯片部分，能在不受其它邏輯塊的影響下自主運作。 FPGA實例應(yīng)用場景包含基因計算、金融分析、深度學(xué)習(xí)、大數(shù)據(jù)、加解密等，例如FPGA針對特定算法，如快速傅里葉變換，基因序列比對算法(Smith-Waterman)，實現(xiàn)快速計算，納秒級延時，提升計算性能。 FPGA加速云服務(wù)器技術(shù)規(guī)格特點如下：來自：百科![]()
超高I/O型 彈性云服務(wù)器 適用于高性能關(guān)系型數(shù)據(jù)庫，NoSQL數(shù)據(jù)庫(Cassandra、MongoDB等)以及ElasticSearch搜索等場景。 （5）高性能計算型 基因工程、游戲動畫、生物制藥的計算和存儲系統(tǒng)。 （6）GPU加速型 GPU加速型云服務(wù)器（GPU Accelerated Cloud Server來自：百科![]()
Subread如何安裝 時間：2020-11-03 15:37:24 簡介 一種通用的read對比軟件，它可以對比基因組DNA-seq和RNA-seq的reads，也可以用于發(fā)現(xiàn)基因組突變，包括短插入缺失和結(jié)構(gòu)變異。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境 1）安裝相關(guān)依賴。 yum install-y來自：百科![]()
Bowtie是一個快速的，較為節(jié)省內(nèi)存的短序列拼接至模板基因組的工具。它在拼接35堿基長度的序列時，可以達到每小時2.5億次的拼接速度。Bowtie并不是一個簡單的拼接工具，它不同于Blast等。它適合的工作是將小序列對比至大基因組上去。它最長能讀取1024個堿基的片段。 配置流程 1來自：百科![]()
smartdenovo是什么 時間：2020-11-05 11:04:16 簡介 smartdenovo是一個同時適用于pacbio和nanopore測序數(shù)據(jù)的denovo組裝軟件，它是一款基于C語言開發(fā)的開源軟件。相較于其他組裝軟件(如：canu、falcon)，smartdenovo組裝可從raw來自：百科![]()
大規(guī)模網(wǎng)絡(luò)容器實例調(diào)度：支持大規(guī)模、高并發(fā)的容器創(chuàng)建和管理 隨啟隨用、按需付費：容器按需啟動，按資源規(guī)格和使用時長付費 圖1大數(shù)據(jù)AI計算場景 生物基因、藥物研發(fā)等科學(xué)計算 生物基因、藥品研發(fā)等領(lǐng)域需要高性能、密集型計算，同時對成本較敏感，需要低成本、免運維的計算平臺?？茖W(xué)計算一般都是任務(wù)型計算，快速申請大量資源，完成后快速釋放。來自：百科![]()
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SpeedSeq是什么 時間：2020-11-03 14:58:13 簡介 SpeedSeq是一個快速基因組分析和注釋的靈活框架，發(fā)表在Nature Method上，封裝了大量基因組分析的軟件，比如比對軟件BWA，calling SNP軟件freebays，SV鑒定軟件lumpy等。來自：百科![]()
基于GCS構(gòu)建基因測序平臺 本通過一個示例Demo介紹如何基于GCS構(gòu)建一個基因測序平臺。 Demo下載地址 https://mirrors.huaweicloud.com/gcs-sdk/GCS_CloudOnCloud_SDK.rar 示例demo源碼只實現(xiàn)了最基礎(chǔ)的功能，不可直接作為商業(yè)軟件使用。來自：幫助中心![]()
適用于均衡場景，針對出海特定場景，助力企業(yè)出海 適用于網(wǎng)站和Web應(yīng)用、中輕載電商平臺搭建、中輕載企業(yè)應(yīng)用 適用于大數(shù)據(jù)、HPC(渲染、基因)、政企應(yīng)用、建站、電商等 適用于對計算和網(wǎng)絡(luò)性能和穩(wěn)定性要求較高的場景 帶寬 5M 5M 5M 5M 5M 數(shù)據(jù)盤 100G 100G來自：專題![]()
為各行各業(yè)量身定做的特色OA應(yīng)用來了-下 相關(guān)推薦 應(yīng)用場景:高校/培訓(xùn)機構(gòu) 產(chǎn)品概述:Classroom特性 方案概述:方案架構(gòu) 應(yīng)用場景:基因組分析 Kubeflow部署:Kubeflow的誕生背景 使用Kubeflow和Volcano實現(xiàn)典型AI訓(xùn)練任務(wù):Kubeflow的誕生背景和運行AI計算任務(wù)面臨的問題來自：云商店![]()
術(shù)讓農(nóng)業(yè)真正走向數(shù)字化、智能化。 種業(yè)是農(nóng)業(yè)的“芯片”，是關(guān)系國計民生的戰(zhàn)略性、基礎(chǔ)性核心產(chǎn)業(yè)。基因育種技術(shù)的難點之一在于研究對象極其復(fù)雜。“宇宙原子數(shù)量約為10的80次方，而在基因育種中，科學(xué)家研究對象的復(fù)雜度更遠遠超過這個數(shù)字億萬倍。”吳剛介紹，華為推出的AI大模型，集合了技來自：百科![]()
產(chǎn)品概述:Classroom特性 Kubeflow部署:Kubeflow的誕生背景 應(yīng)用場景:基因組分析 使用Kubeflow和Volcano實現(xiàn)典型AI訓(xùn)練任務(wù):Kubeflow的誕生背景和運行AI計算任務(wù)面臨的問題 應(yīng)用場景:生物基因、藥物研發(fā)等科學(xué)計算 方案概述:方案架構(gòu) 導(dǎo)讀 軟件DevOps云化發(fā)展的趨勢:華為公司管理過程的變化來自：云商店
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