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  • 二代測序 內(nèi)容精選 換一換
  • 云知識(shí) HTSlib是什么 HTSlib是什么 時(shí)間:2020-11-03 10:43:01 簡介 HTSlib是一個(gè)C庫,用于讀取和寫入高通量測序數(shù)據(jù)。HTSlib是SAMtools使用的核心庫。HTSlib還提供了bgzip,htsfile和tabix實(shí)用程序。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境
    來自:百科
    什么是Delly 時(shí)間:2020-11-03 09:51:08 Delly是一種集成的結(jié)構(gòu)變異(SV)預(yù)測方法,可以在短期讀取的大規(guī)模并行測序數(shù)據(jù)中以單核苷酸分辨率發(fā)現(xiàn)基因分型和可視化缺失、串聯(lián)重復(fù)、倒位和易位等缺陷。它使用配對末端,拆分閱讀和閱讀深度來敏感而準(zhǔn)確地描繪整個(gè)基因組的重排。
    來自:百科
  • 二代測序 相關(guān)內(nèi)容
  • ,例如 1.家庭安防,cloud VR,智能工廠等業(yè)務(wù)場景需要的是ARM原生的鯤鵬、AI大算力的昇騰和GPU圖像處理的多樣算力。 2.基因測序、高性能計(jì)算、媒體內(nèi)容分析等業(yè)務(wù)場景需要的是可業(yè)務(wù)封裝的云容器、并發(fā)處理的批量計(jì)算(Batch)、靈活業(yè)務(wù)響應(yīng)的Serverless的多形粒度。
    來自:百科
    華為云計(jì)算 云知識(shí) edgeR是什么 edgeR是什么 時(shí)間:2020-11-03 16:03:07 簡介 edgeR是R語言軟件包,主要用于DNA測序技術(shù)產(chǎn)生的計(jì)數(shù)數(shù)據(jù)差異分析。特別是設(shè)計(jì)用于RNA-Seq或SAGE數(shù)據(jù)的差異表達(dá)分析。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境 1)安裝相關(guān)依賴。 apt-get
    來自:百科
  • 二代測序 更多內(nèi)容
  • 能力解決方案,可用于解決計(jì)算密集型、海量數(shù)據(jù)處理等業(yè)務(wù)的計(jì)算需求,如科學(xué)研究、氣象預(yù)報(bào)、計(jì)算模擬、軍事研究、CAD/CAE、生物制藥、基因測序、圖像處理等,縮短需要的大量計(jì)算時(shí)間,提高計(jì)算精度。 公有云上部署HPC的優(yōu)勢: 傳統(tǒng)的HPC使用中存在如下問題: 投資成本高,擴(kuò)容部署復(fù)雜,重復(fù)利用已有投資十分困難。
    來自:百科
    如高性能計(jì)算、 媒體處理 、文件共享和內(nèi)容管理和Web服務(wù)等。 說明:高性能計(jì)算:主要是高帶寬的需求,用于共享文件存儲(chǔ),比如基因測序、圖片渲染這些。 如大數(shù)據(jù)分析、靜態(tài)網(wǎng)站托管、在線 視頻點(diǎn)播 、基因測序和智能視頻監(jiān)控等。 如高性能計(jì)算、企業(yè)核心集群應(yīng)用、企業(yè)應(yīng)用系統(tǒng)和開發(fā)測試等。 說明:高性能計(jì)算:主要是
    來自:專題
    內(nèi)存優(yōu)化型 彈性云服務(wù)器 典型代表型號(hào)包括:M6型彈性云服務(wù)器、M3ne型彈性云服務(wù)器、M3型彈性云服務(wù)器、M2型彈性云服務(wù)器、M1型彈性云服務(wù)器 M6型彈性云服務(wù)器搭載第二代英特爾® 至強(qiáng)® 可擴(kuò)展處理器 ,多項(xiàng)技術(shù)優(yōu)化,計(jì)算性能強(qiáng)勁穩(wěn)定。配套25GE智能高速網(wǎng)卡,提供超高網(wǎng)絡(luò)帶寬和PPS收發(fā)包能力;提供最大5
    來自:百科
    人基因組的軟件包。BWA主要是由三種算法組成:BWA-backtrack、BWA-SW和BWA-MEM。第一個(gè)算法是針對于illumina測序reads最多100bp的算法。后面兩個(gè)主要是針對于從70bp到1Mbp的更長序列。BWA-SW和BWA-MEM擁有一些相同的特征例如長r
    來自:百科
    金融、證券等行業(yè)對業(yè)務(wù)部署的合規(guī)性,以及某些客戶對數(shù)據(jù)安全有苛刻的要求。采用裸金屬服務(wù)器部署,能夠確保資源獨(dú)享、數(shù)據(jù)隔離、可監(jiān)管可追溯。 高性能計(jì)算場景 超算中心、基因測序等高性能計(jì)算場景,處理的數(shù)據(jù)量大,對服務(wù)器的計(jì)算性能、穩(wěn)定性、實(shí)時(shí)性等要求很高,裸金屬服務(wù)器可以滿足高性能計(jì)算的需求。 核心數(shù)據(jù)庫場景 某
    來自:百科
    夠彈性伸縮至PB規(guī)模,具備高可用性和持久性,為海量數(shù)據(jù)、高帶寬型應(yīng)用提供有力支持。適用于多種應(yīng)用場景: HPC:在仿真實(shí)驗(yàn)、生物制藥、基因測序、圖像處理、科學(xué)研究、氣象預(yù)報(bào)等涉及高性能計(jì)算解決大型計(jì)算問題的行業(yè),彈性文件系統(tǒng)為其計(jì)算能力、存儲(chǔ)效率、網(wǎng)絡(luò)帶寬及時(shí)延提供重要保障。 媒
    來自:百科
    件電路,滿足機(jī)器學(xué)習(xí)中海量計(jì)算和極低時(shí)延的要求。因此,F(xiàn)PGA在滿足機(jī)器學(xué)習(xí)的硬件需求上提供極具吸引力的替代方案。 基因組學(xué)研究:通過基因測序和分析、生物和醫(yī)療信息等海量數(shù)據(jù)的快速分析,可實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療;同時(shí)在藥物研發(fā)、分子育種等領(lǐng)域都有海量數(shù)據(jù)的處理,該領(lǐng)域需要硬件加速來解決生物
    來自:百科
    節(jié)點(diǎn)之間進(jìn)行緊密的通信,要求文件系統(tǒng)高帶寬、低時(shí)延。 生物科學(xué):要求參與大數(shù)據(jù)計(jì)算的文件系統(tǒng)高帶寬、高存儲(chǔ)且易于擴(kuò)展。 對生物基因數(shù)據(jù)進(jìn)行測序、拼接、比對等處理,提供基因組信息以及相關(guān)數(shù)據(jù)系統(tǒng)的生物信息學(xué)領(lǐng)域。 進(jìn)行大規(guī)模分子動(dòng)力學(xué)模擬來分析和驗(yàn)證蛋白質(zhì)在分子和原子水平上的變化的分子動(dòng)力學(xué)模擬領(lǐng)域。
    來自:專題
    最大網(wǎng)絡(luò)收發(fā)包:100萬PPS 最大內(nèi)網(wǎng)帶寬:6Gbps   通用計(jì)算型S6 CPU/內(nèi)存配比:1:1/1:2/1:4 vCPU數(shù)量范圍:1-8 處理器:第二代英特爾® 至強(qiáng)® 可擴(kuò)展處理器 基頻/睿頻:2.6GHz/3.5GHz 超高IO 通用型SSD 高IO 支持IPv6 實(shí)例網(wǎng)絡(luò)性能與計(jì)算規(guī)格對應(yīng),規(guī)格越高網(wǎng)絡(luò)性能越強(qiáng)
    來自:專題
    最大網(wǎng)絡(luò)收發(fā)包:100萬PPS 最大內(nèi)網(wǎng)帶寬:6Gbps   通用計(jì)算型S6 CPU/內(nèi)存配比:1:1/1:2/1:4 vCPU數(shù)量范圍:1-8 處理器:第二代英特爾® 至強(qiáng)® 可擴(kuò)展處理器 基頻/睿頻:2.6GHz/3.5GHz 超高IO 通用型SSD 高IO 支持IPv6 實(shí)例網(wǎng)絡(luò)性能與計(jì)算規(guī)格對應(yīng),規(guī)格越高網(wǎng)絡(luò)性能越強(qiáng)
    來自:專題
    靈活定制 可基于計(jì)算模式,靈活調(diào)整架構(gòu),適合于廣泛、多變的混合負(fù)載場景 高性價(jià)比 提供高性能、低功耗和低成本的解決方案 基因組學(xué)研究 通過基因測序和分析、生物和醫(yī)療信息等海量數(shù)據(jù)的快速分析,可實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療;同時(shí)在藥物研發(fā)、分子育種等領(lǐng)域都有海量數(shù)據(jù)的處理,該領(lǐng)域需要硬件加速來解決生物
    來自:百科
    華為云計(jì)算 云知識(shí) Wtdbg2是什么 Wtdbg2是什么 時(shí)間:2020-11-05 11:29:41 簡介 Wtdbg2是一個(gè)三代測序數(shù)據(jù)(同時(shí)適用于pacbio和nanopore)denovo組裝軟件,它是一款基于C語言開發(fā)的開源軟件。相較于其他三代數(shù)據(jù)組裝軟件(Canu,
    來自:百科
    多云/混合云解決方案,就可以將開發(fā)環(huán)境的集群和生產(chǎn)環(huán)境的集群統(tǒng)一管理,實(shí)現(xiàn)應(yīng)用線上發(fā)布的全自動(dòng)流水線。 業(yè)務(wù)與計(jì)算分離場景 對于AI、基因測序、視頻處理等行業(yè)的用戶,其計(jì)算任務(wù)依賴特殊的硬件,如CPU、裸金屬服務(wù)器等,通過華為容器多云/混合云解決方案,用戶就可以將計(jì)算業(yè)務(wù)部署在云
    來自:百科
    金融、證券等行業(yè)對業(yè)務(wù)部署的合規(guī)性,以及某些客戶對數(shù)據(jù)安全有苛刻的要求。采用裸金屬服務(wù)器部署,能夠確保資源獨(dú)享、數(shù)據(jù)隔離、可監(jiān)管可追溯。 2、高性能計(jì)算場景 超算中心、基因測序等高性能計(jì)算場景,處理的數(shù)據(jù)量大,對服務(wù)器的計(jì)算性能、穩(wěn)定性、實(shí)時(shí)性等要求很高。虛擬化帶來的性能損耗和超線程等對裸金屬服務(wù)器影響不大,裸金屬服務(wù)器可以滿足高性能計(jì)算的需求。
    來自:百科
    ,在處理高負(fù)載、多線程、大數(shù)據(jù)量計(jì)算的業(yè)務(wù)時(shí)依然穩(wěn)定強(qiáng)勁。 旗艦機(jī)皇:C6云服務(wù)器 主打重負(fù)載場景,數(shù)據(jù)庫、中大型電商/網(wǎng)站、視頻類、基因測序等。集高計(jì)算性能、強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)性能于一身,滿足高負(fù)載、高并發(fā)場景的業(yè)務(wù)需求。40Gbps最大內(nèi)網(wǎng)帶寬,超低內(nèi)網(wǎng)時(shí)延,內(nèi)存頻率2933MHZ,網(wǎng)絡(luò)
    來自:百科
    倉庫、基因測序、生物制藥等對資源獨(dú)享,性能要求高的場景。用戶可申請獨(dú)占物理設(shè)備,獨(dú)享計(jì)算,從而保證業(yè)務(wù)穩(wěn)定運(yùn)行。 專屬計(jì)算集群(Dedicated Computing Cluster,簡稱DCC)為用戶提供物理隔離的云上專屬計(jì)算資源池。適用于金融安全、 數(shù)據(jù)倉庫 、基因測序、生物制藥
    來自:專題
    金融、證券等行業(yè)對業(yè)務(wù)部署的合規(guī)性,以及某些客戶對數(shù)據(jù)安全有苛刻的要求。采用裸金屬服務(wù)器部署,能夠確保資源獨(dú)享、數(shù)據(jù)隔離、可監(jiān)管可追溯。 2、高性能計(jì)算場景 超算中心、基因測序等高性能計(jì)算場景,處理的數(shù)據(jù)量大,對服務(wù)器的計(jì)算性能、穩(wěn)定性、實(shí)時(shí)性等要求很高。虛擬化帶來的性能損耗和超線程等對裸金屬服務(wù)器影響不大,裸金屬服務(wù)器可以滿足高性能計(jì)算的需求。
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