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  • gcs基因容器 內(nèi)容精選 換一換
  • 本文介紹了【萬萬沒想到,云原生基礎(chǔ)設(shè)施還能加速農(nóng)作物基因測序】相關(guān)內(nèi)容,與您搜索的gcs基因容器相關(guān),助力開發(fā)者獲取技術(shù)信息和云計算技術(shù)生態(tài)圈動態(tài)...請點擊查閱更多詳情。
    來自:其他
    - sh /obs/gcscli/run-xxx/run.sh 1 a - sh /obs/gcscli/run-xxx/run.sh 2 a - sh /obs/gcscli/run-xxx/run.sh 1 b - sh /obs/gcscli/run-xxx/run
    來自:幫助中心
  • gcs基因容器 相關(guān)內(nèi)容
  • "domain": "gcs_container", "domain_id": "024014b87********30fbe790bda3e6", "vendor": "基因容器團(tuán)隊", "image":
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    指定需要創(chuàng)建的模板名稱,上傳新的模板。同名模板上傳兩次會報錯。gcs create workflowFILENAME [params]workflow可以簡寫為wf,即:gcs create wf WORKFLOWID [params]創(chuàng)建 workflow。這里以 GATK 流程為例,首先,依據(jù) 流程語法說明,編寫 YAML 文件。
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  • gcs基因容器 更多內(nèi)容
  • "Action": [ "gcs:workflows:create", "gcs:workflows:list", "gcs:executions:create" ]
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    G CS Client()創(chuàng)建GCSClient實例。向GCS發(fā)送任一請求之前,必須先創(chuàng)建一個GCSClient實例。初始化的實例中參數(shù)值為空,需要通過用戶名/密碼方式初始化入?yún)⒒駻K/SK方式初始化入?yún)⒊跏蓟雲(yún)?,然后才能通過實例調(diào)用GCS提供的其它接口。無返回一個GCSClient實例,通過該實例調(diào)用GCS提供的接口。
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    流程設(shè)計器 基因容器的流程中至少有一個工具,流程中每個工具會根據(jù)它們的先后順序形成數(shù)據(jù)流,前一個工具會為后一個工具提供輸入。 基因容器的流程設(shè)計器是一種用于創(chuàng)建、查看、修改流程的圖形化工具。借助流程設(shè)計器,您可以拖拽工具到畫布中,可視化連接各工具,指定工具間的先后順序。 不管您是
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    測序平臺:面向用戶提供測序服務(wù),通過調(diào)用GCS的API響應(yīng)用戶的測序需求。當(dāng)用戶想發(fā)起測序請求時,調(diào)用GCS的API執(zhí)行測序,待測序完成后獲取測序結(jié)果并返回給用戶。 GCS服務(wù):提供底層測序API共測序平臺調(diào)用。 從上面的描述可以看出,測序平臺相當(dāng)于用戶與GCS之間的一個代理,將用戶的測序請求轉(zhuǎn)發(fā)給GCS處理,然
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    本文介紹了【華為云容器和微服務(wù)是什么】相關(guān)內(nèi)容,與您搜索的gcs基因容器相關(guān),助力開發(fā)者獲取技術(shù)信息和云計算技術(shù)生態(tài)圈動態(tài)...請點擊查閱更多詳情。
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    與其它云服務(wù)的關(guān)系 基因容器服務(wù)與華為云其它服務(wù)的關(guān)系如圖1所示。 圖1 基因容器與華為云服務(wù)的關(guān)系 云容器引擎(CCE) 基因容器使用的底層資源均由CCE服務(wù)創(chuàng)建。云容器引擎(Cloud Container Engine)提供高可靠高性能的企業(yè)級容器應(yīng)用管理服務(wù),支持Kuber
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    ouputs 可選項,用于定義數(shù)據(jù)處理流程完成后,最終生成的結(jié)果文件列表。結(jié)果文件列表在基因容器服務(wù)的控制臺界面展示,此外,為了讓您更直觀的查看結(jié)果文件,基因容器集成 IGV(IGV的詳細(xì)描述請參見http://www.igv.org/)軟件,您通過控制臺即可查看到通過IGV軟件轉(zhuǎn)換后的可視化結(jié)果文件。
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    產(chǎn)品優(yōu)勢 基因容器基于Kubernetes智能化基因計算任務(wù)調(diào)度和Spark等加速服務(wù),為您提供低成本高性能的基因測序解決方案。支持對接深度學(xué)習(xí)框架,方便您深度解讀報告。 秒級并發(fā) 基因容器利用容器技術(shù)的秒級并發(fā)能力,可將WGS從30小時縮短至5小時以內(nèi),對比同類競品,使用相同樣本的情況下,資源利用率大幅提升。
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    清理環(huán)境 為了防止您為不需要的服務(wù)付費(fèi),建議您使用完成后清理環(huán)境。環(huán)境清理后基因容器服務(wù)將不再使用該命名空間,命名空間還將為您保留。如默認(rèn)環(huán)境被清理,則最新創(chuàng)建的環(huán)境會自動變成默認(rèn)環(huán)境。 登錄GCS控制臺,選擇左側(cè)導(dǎo)航欄的“環(huán)境管理”。 單擊“云容器實例”頁簽,在需要清理的環(huán)境中單擊“清理環(huán)境”。
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    權(quán)servicestage的同時也會授權(quán)GCS,反之亦然。 為解決該問題,GCS服務(wù)提供了新的委托方式,后續(xù)若您不再使用GCS服務(wù),可直接刪除委托“gcs_admin_trust”,該操作將只影響GCS,不影響您使用其他服務(wù)。 由于GCS在運(yùn)行中對存儲、容器等各類云服務(wù)資源都存在
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    本文介紹了【數(shù)字化轉(zhuǎn)型“軍艦”啟航:詳解華為云容器全新解決方案】相關(guān)內(nèi)容,與您搜索的gcs基因容器相關(guān),助力開發(fā)者獲取技術(shù)信息和云計算技術(shù)生態(tài)圈動態(tài)...請點擊查閱更多詳情。
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    400 GCS.4006004 Bad request, tool not exist. 請求錯誤,請求的tool不存在 400 GCS.4006007 Bad request, request body is invalidate. 請求錯誤,請求體非法 400 GCS.4006009
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    ttps://GCS_ENDPOINT”。 export GCS_Endpoint="https://gcs.cn-north-4.myhuaweicloud.com" 創(chuàng)建環(huán)境。 調(diào)用5.1.1-部署Environment接口,利用前提條件中已創(chuàng)建的集群創(chuàng)建GCS環(huán)境。 curl
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    本文介紹了【今天你“云原生”了嗎?】相關(guān)內(nèi)容,與您搜索的gcs基因容器相關(guān),助力開發(fā)者獲取技術(shù)信息和云計算技術(shù)生態(tài)圈動態(tài)...請點擊查閱更多詳情。
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    type: GCS.Job resources: memory: 1g cpu: 0.5c commands: - echo "A" b: tool: bwa:0.7.12 type: GCS.Job
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    type: GCS.Job resources: memory: 1g cpu: 0.5c commands: - sh /obs/gcscli/run-xxx/run.sh 1 a - sh /obs/gcscli/run-xxx/run
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    resource= '{ "name":"gcs-wf", "description":"my workflow", "logo":"hw-gcs-logo-cn-north-4-cd059ba3c286470e8c5c2deeb02a08c1:gcs-wf-Desert.jpg",
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