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- gcs基因容器 內(nèi)容精選 換一換
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本文介紹了【這件“小棉襖”，真心不簡單】相關(guān)內(nèi)容，與您搜索的gcs基因容器相關(guān)，助力開發(fā)者獲取技術(shù)信息和云計(jì)算技術(shù)生態(tài)圈動(dòng)態(tài)...請點(diǎn)擊查閱更多詳情。來自：其他，從而幫助基因測序企業(yè)實(shí)現(xiàn)提高基因檢測的效率和質(zhì)量。 華為云基因容器服務(wù)（G CS ），是業(yè)界首個(gè)基于Kubernetes平臺(tái)，結(jié)合Docker容器技術(shù)打造的基因測序云服務(wù)。相對行業(yè)中傳統(tǒng)使用的HPC高性能計(jì)算集群，基因容器服務(wù)有著明顯的領(lǐng)先優(yōu)勢： 資源調(diào)度更靈活 計(jì)算可以按需伸縮 任務(wù)流程方便自定義來自：其他
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chive gcs:workflows:download obs:object:GetObject √ √ 創(chuàng)建tool POST /v1/tools gcs:tools:create - √ √ 查詢tool GET /v1/tools/{tool_id} gcs:tools:get來自：幫助中心獲取默認(rèn)環(huán)境下對應(yīng)的sfs pvc name列表。gcs get sfs無無返回值：來自：幫助中心
- gcs基因容器 更多內(nèi)容
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提交一組并行的 shell 腳本，作為多個(gè) job 在后臺(tái)執(zhí)行。gcs sub repjob FILENAME [params]rejob可以簡寫為rjb，即：gcs sub rjb FILENAME [params]提交多個(gè)并行 shell 腳本具體格式如下：首先準(zhǔn)備需要并行的單一腳本 bwa_mem.sh，對 fastq 原始文件來自：幫助中心![]()
下載kubetcl命令行工具，并進(jìn)行相關(guān)配置。gcs get kubectlkubectl可以簡寫為kube，即：gcs get kube無執(zhí)行本命令前請先刪除當(dāng)前目錄下當(dāng)前目錄下 kubectl* 相關(guān)文件及目錄。命令執(zhí)行完成后，根據(jù)使用場景，按需切換kubectl的訪問模式。VPC網(wǎng)絡(luò)內(nèi)接入訪問請執(zhí)行此命令。kubectl confi來自：幫助中心![]()
查看命令行工具的軟件版本以及編譯平臺(tái)。gcs versionversion可以簡寫為ver，即：gcs ver查看軟件版本：示例執(zhí)行結(jié)果：來自：幫助中心![]()
查看任務(wù)信息。gcs get executionEXECUTIONID [params]execution可以簡寫為exec，即：gcs get execEXECUTIONID [params]可以直接執(zhí)行 gcs get execution，顯示所有任務(wù)情況。也可以 gcs get execution executionID 指定顯示單來自：幫助中心![]()
終止指定的WDL流程。gcs set wdl ID[flags]終止指定流程。返回內(nèi)容如下。來自：幫助中心![]()
了解華為云 新聞報(bào)道 華為云全球首發(fā)基因容器 推動(dòng)基因計(jì)算邁入新紀(jì)元 新聞報(bào)道 華為云全球首發(fā)基因容器 推動(dòng)基因計(jì)算邁入新紀(jì)元 2018-10-18 10月11日，在2018華為全聯(lián)接大會(huì)上，華為云全球首家推出了以kubernetes為基礎(chǔ)的基因容器服務(wù)。基因容器將基因測序和容器技術(shù)這兩個(gè)來自：其他![]()
利用FILENAME參數(shù)提供的流程文件直接創(chuàng)建execution。提示：該命令行不會(huì)新建workflow模板。如果已經(jīng)有workflow模板，推薦直接使用gcs create exection。gcs sub workflow FILENAME [params]workflow可以簡寫為wf，即：gcs sub wf FILENAME來自：幫助中心![]()
查看模板信息。gcs del workflowWORKFLOWID [WORKFLOWID2 WORKFLOWID3...]workflow可以簡寫為wf，即：gcs del wfWORKFLOWID [WORKFLOWID2 WORKFLOWID3...]刪除workflow 之前，需要?jiǎng)h除所有引用該workflow 的 executi來自：幫助中心![]()
云容器引擎是由一系列 彈性云服務(wù)器 組成的一個(gè)Kubernetes集群，基因容器所有執(zhí)行的分析流程都會(huì)運(yùn)行在這個(gè)集群中。如果您對集群并不了解，請查看集群概述，了解集群概念、集群和虛擬私云及子網(wǎng)間關(guān)系、集群和節(jié)點(diǎn)的使用約束。 創(chuàng)建環(huán)境 開始基因分析前，請先創(chuàng)建環(huán)境。 登錄GCS控制臺(tái)，選擇左側(cè)導(dǎo)航欄的“環(huán)境管理”，在右側(cè)頁面單擊“創(chuàng)建環(huán)境”。來自：幫助中心![]()
查看workflow信息。gcs get workflow WORKFLOWID [params]workflow可以簡寫為wf，即：gcs get wf WORKFLOWID [params]獲取所有模板信息。gcs get workflow workflow_id name來自：幫助中心![]()
創(chuàng)建execution。gcs create execution WORKFLOWID [params]execution可以簡寫為exec，即：gcs create exec WORKFLOWID [params]該命令的輸入?yún)?shù)是 workflowID，可以通過 gcs get worflowID 查詢后，根據(jù)name/versi來自：幫助中心![]()
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更新流程的相關(guān)信息。目前命令行只支持更改描述信息以及流程文件（已經(jīng)使用中的流程不能更改流程文件）gcs update workflowworkflow-id [params]workflow可以簡寫為wf，即：gcs update wfworkflow-id [params]更新某個(gè)流程的描述信息來自：幫助中心![]()
指定需要?jiǎng)?chuàng)建的模板名稱，上傳新的模板。同名模板上傳兩次會(huì)報(bào)錯(cuò)。gcs create workflowFILENAME [params]workflow可以簡寫為wf，即：gcs create wf WORKFLOWID [params]創(chuàng)建 workflow。這里以 GATK 流程為例，首先，依據(jù) 流程語法說明，編寫 YAML 文件。來自：幫助中心
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