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  • 基因容器 內(nèi)容精選 換一換
  • 動態(tài)。 基因容器(GeneContainer Service,G CS )提供云端基因解決方案,支持DNA、RNA等主流生物基因測序場景。基因容器基于輕量級容器技術(shù),結(jié)合大數(shù)據(jù)、深度學(xué)習(xí)算法,優(yōu)化官方標(biāo)準(zhǔn)算法,為您提供靈活可定制的測序流程、秒級可伸縮的高可靠資源。 基因容器作為基因測
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    與其它云服務(wù)的關(guān)系 基因容器服務(wù)與華為云其它服務(wù)的關(guān)系如圖1所示。 圖1 基因容器與華為云服務(wù)的關(guān)系 云容器引擎(CCE) 基因容器使用的底層資源均由CCE服務(wù)創(chuàng)建。云容器引擎(Cloud Container Engine)提供高可靠高性能的企業(yè)級容器應(yīng)用管理服務(wù),支持Kuber
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  • 基因容器 相關(guān)內(nèi)容
  • 使用前必讀 概述 基因容器(GeneContainer Service,GCS)提供云端基因測序解決方案,支持DNA、RNA、液態(tài)活檢等主流生物基因測序場景。基因容器基于輕量級容器技術(shù),結(jié)合大數(shù)據(jù)、深度學(xué)習(xí)算法,優(yōu)化官方標(biāo)準(zhǔn)算法,為您提供靈活可定制的測序流程、秒極可伸縮的高可靠資源。
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    ouputs 可選項,用于定義數(shù)據(jù)處理流程完成后,最終生成的結(jié)果文件列表。結(jié)果文件列表在基因容器服務(wù)的控制臺界面展示,此外,為了讓您更直觀的查看結(jié)果文件,基因容器集成 IGV(IGV的詳細描述請參見http://www.igv.org/)軟件,您通過控制臺即可查看到通過IGV軟件轉(zhuǎn)換后的可視化結(jié)果文件。
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  • 基因容器 更多內(nèi)容
  • 產(chǎn)品優(yōu)勢 基因容器基于Kubernetes智能化基因計算任務(wù)調(diào)度和Spark等加速服務(wù),為您提供低成本高性能的基因測序解決方案。支持對接深度學(xué)習(xí)框架,方便您深度解讀報告。 秒級并發(fā) 基因容器利用容器技術(shù)的秒級并發(fā)能力,可將WGS從30小時縮短至5小時以內(nèi),對比同類競品,使用相同樣本的情況下,資源利用率大幅提升。
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    指定的PVC必須存在。 基因容器服務(wù)提供了3個內(nèi)置的共享存儲可供掛載,分別為: ${GCS_REF_PVC},基因容器提供的參考組 OBS 桶。 ${GCS_DATA_PVC} ,關(guān)聯(lián)OBS桶,表示基因容器環(huán)境關(guān)聯(lián)的OBS桶。 ${GCS_SFS_PVC},加速SFS卷,表示基因容器環(huán)境關(guān)聯(lián)的SFS卷。
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    ,存儲容災(zāi)服務(wù)的權(quán)限才能生效。 表1 GCS系統(tǒng)策略 策略名稱 描述 策略類型 依賴關(guān)系 GCS FullAccess 基因容器服務(wù)的管理員權(quán)限。擁有基因容器服務(wù)所有操作權(quán)限。 系統(tǒng)策略 依賴如下策略,請同時授予如下權(quán)限。 OBS OperateAccess:全局級策略,請在“全局區(qū)域
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    本文介紹了【全球主流基因測序云平臺分析】相關(guān)內(nèi)容,與您搜索的基因容器相關(guān),助力開發(fā)者獲取技術(shù)信息和云計算技術(shù)生態(tài)圈動態(tài)...請點擊查閱更多詳情。
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    鍵創(chuàng)建按量付費的“集群”和“ 彈性云服務(wù)器 (下文中簡稱為ECS節(jié)點)”等資源。 區(qū)域限制 當(dāng)前僅支持在華北區(qū)進行測序計算。 配額限制 使用基因容器執(zhí)行測序時,需注意以下配額限制: 每個用戶默認(rèn)最多創(chuàng)建5個環(huán)境; 每個用戶默認(rèn)最多創(chuàng)建100個自定義流程,每個用戶執(zhí)行流程次數(shù)不能超過500次;
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    后順序關(guān)系形成數(shù)據(jù)流,前序工具為后序工具提供輸入。基因容器為您提供了多套典型的測序流程,基于此流程,您可以快速完成測序任務(wù)。 工具(Tool) 工具是生物信息軟件的鏡像封裝,工具既可以編排入流程串聯(lián)使用,也可以獨立使用,基因容器提供了大量的公共工具,同時用戶可以制作自定義工具,這些工具都存放在測序倉庫中。
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    應(yīng)對大規(guī)模的,波動的計算任務(wù),公有云靈活性的特點非常有優(yōu)勢 使用的 華為云產(chǎn)品 服務(wù) 基因容器GCS服務(wù) 基因容器(GeneContainer Service,GCS)提供云端基因解決方案,支持DNA、RNA等主流生物基因測序場景。基因容器基于輕量級容器技術(shù),結(jié)合大數(shù)據(jù)、深度學(xué)習(xí)算法,優(yōu)化官方標(biāo)準(zhǔn)算法,
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    本文介紹了【【資料搶先看】HUAWEI CONNECT 2018大會現(xiàn)場演講/展示資料】相關(guān)內(nèi)容,與您搜索的基因容器相關(guān)。邀你共享云計算使用和開發(fā)經(jīng)驗,匯聚云上智慧,共贏智慧未來...更多詳情請點擊查閱。
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    IAM 控制臺創(chuàng)建用戶組,并授予基因容器服務(wù)只讀權(quán)限“GCS ReadOnlyAccess”。 創(chuàng)建用戶并加入用戶組。 在IAM控制臺創(chuàng)建用戶,并將其加入1.創(chuàng)建用戶組并授權(quán)中創(chuàng)建的用戶組。 用戶登錄并驗證權(quán)限。 新創(chuàng)建的用戶登錄控制臺,驗證基因容器服務(wù)的只讀權(quán)限。 父主題: 權(quán)限管理
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    會自動變成默認(rèn)環(huán)境。 如果您使用的環(huán)境是云容器實例,環(huán)境清理后,基因容器將不再使用該命名空間,但是命名空間并未刪除。如果需要刪除命名空間,請前往CCI控制臺刪除。 如果您使用的環(huán)境是云容器引擎,環(huán)境清理后,基因容器將不再使用該集群。對于部署環(huán)境時創(chuàng)建的集群,可以通過入?yún)?ldquo;dele
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    應(yīng)用場景 通用場景 生物基因企業(yè)利用基因容器完成大規(guī)?;蚪M測序分析。 優(yōu)勢 極大提升計算速度,降低運算成本。 流程設(shè)計門檻低、方式多樣,可以通過設(shè)計器、模板甚至可以直接從其他格式模板直接轉(zhuǎn)換 不單獨維護小資源池,可直接使用整個 華為云計算 資源作為基礎(chǔ)。保證資源充足,無需排隊 為生
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    環(huán)境選擇 環(huán)境是基因容器服務(wù)所需要使用的計算資源的集合。基因容器的環(huán)境由云容器實例和云容器引擎提供。 云容器實例 云容器實例(Cloud Container Instance,CCI)服務(wù)提供 Serverless Container(無服務(wù)器容器)引擎,讓您無需創(chuàng)建和管理服務(wù)器
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    workflow 運行在CCI容器中。您只需為作業(yè)運行時實際消耗的計算和存儲資源付費,不需要支付資源之外的附加費用。本文將介紹如何使用在基因容器服務(wù)中使用Cromwell。?
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    參考基因組 基因參考組由正常和病理條件下非正常的分子表達所組成。基因容器提供主流基因參考組,作為基因分析參考。 登錄GCS控制臺,左側(cè)導(dǎo)航欄中選擇“參考基因組”。 圖1 參考基因組頁面 在右側(cè)頁面單擊“查看”,可查看基因參考組的詳細情況。 圖2 基因參考組詳情 單擊“下載”,可下
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    工具是生物信息軟件的鏡像封裝,工具既可以編排入流程串聯(lián)使用,也可以獨立使用。您可以基于基因容器為您提供業(yè)界主流的基因數(shù)據(jù)處理工具,當(dāng)前已支持的公共工具請參見公共工具的范圍。您可以直接使用公共工具來創(chuàng)建流程,如執(zhí)行工具。此外,基因容器也支持添加自有工具并支持對接第三方數(shù)據(jù)處理服務(wù),您可以添加私有工具來
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    本文介紹了【這件“小棉襖”,真心不簡單】相關(guān)內(nèi)容,與您搜索的基因容器相關(guān),助力開發(fā)者獲取技術(shù)信息和云計算技術(shù)生態(tài)圈動態(tài)...請點擊查閱更多詳情。
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    數(shù)據(jù)管理 基因容器使用對象存儲服務(wù)OBS和彈性文件服務(wù)SFS存儲分析前后產(chǎn)生的數(shù)據(jù),其中包括原始基因數(shù)據(jù)、流程執(zhí)行中間數(shù)據(jù)及執(zhí)行結(jié)果數(shù)據(jù)。CCE環(huán)境支持對象存儲服務(wù)OBS和彈性文件服務(wù)SFS存儲數(shù)據(jù),而由于目前CCI環(huán)境不支持OBS掛載,CCI環(huán)境只能使用SFS存儲數(shù)據(jù)。 基因容
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