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拼接工具，它不同于Blast等。它適合的工作是將小序列對(duì)比至大基因組上去。它最長(zhǎng)能讀取1024個(gè)堿基的片段。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境 安裝相關(guān)依賴(lài)。 yum install gcc gcc-c++zlib-devel-y 2.獲取源碼 獲取“bowtie 1.2.3”源碼包。來(lái)自：百科
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各種繁瑣配置。 配置編譯流程 1.選擇操作環(huán)境 本文選用華為鯤鵬云服務(wù)E CS KC1實(shí)例做測(cè)試 yum install wget -y 2.獲取源代碼 https://gradle.org/releases/ 提供gradle各版本的源碼壓縮包，可以直接下載。 3.配置編譯環(huán)境來(lái)自：百科![]()
執(zhí)行如下命令，編譯源碼。 make -j4 運(yùn)行和驗(yàn)證 1.安裝MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)。 參考《鯤鵬生態(tài)_mysql使用指南》安裝MySQL。若已經(jīng)安裝，則可以跳過(guò)此步驟。 2.啟動(dòng)MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)。 a. root用戶(hù)登錄MySQL數(shù)據(jù)庫(kù)，輸入安裝時(shí)設(shè)置的root用戶(hù)密碼，如圖1-1所示。 圖1-1來(lái)自：百科![]()
的通用瀏覽器。 使用方法 手動(dòng)安裝 chromium的鏡像地址為：https://repo.huaweicloud.com/chromium-browser-snapshots/，手動(dòng)下載請(qǐng)?jiān)L問(wèn)該地址。 Chrome Puppeteer工具安裝配置chromium地址 npm config來(lái)自：百科![]()
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Memcached是基于修訂的BSD許可證授權(quán)的開(kāi)源軟件。 配置編譯流程 1.獲取源代碼 軟件源碼獲?。篽ttps://memcached.org/downloads memcached官網(wǎng)：https://memcached.org/ 2.編譯環(huán)境配置 執(zhí)行如下命令，安裝依賴(lài)包。 yum install gcc來(lái)自：百科![]()
基因，可以使用Ballgown，Cuffdiff或其他（DESeq，edgeR等）專(zhuān)用軟件來(lái)處理StringTie的輸出。 配置流程 1.配置編譯環(huán)境 安裝相關(guān)依賴(lài) yum install-y zlib zlib-devel 2.獲取源碼 獲取“stringtie-1.3.6”源碼包。來(lái)自：百科
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