FPGA基因測序加速為企業(yè)提供海量基因組數(shù)據(jù)分析所需要的計算加速服務，大幅度提升計算性能，同時保證測序精準度，助力精準醫(yī)療、藥物研發(fā)、分子育種等領域解決性能瓶頸。
功能描述
測序數(shù)據(jù)與參考基因組比對
支持BWA比對軟件的FPGA異構加速，顯著提升BWA計算效率，大大縮短數(shù)據(jù)比對時間。經(jīng)測試30x人重測序數(shù)據(jù)(90GB)比對耗時從常規(guī)的20小時下降到2.5小時以內，且比對準確度完全一致。
單個樣本Germline遺傳變異檢測
支持GATK v3.8和GATK v4.0.6版本的HaplotypeCaller模式FPGA異構加速，提高germline突變檢測運行效率，一致率高達99.5%；經(jīng)測試30x人重測序數(shù)據(jù)(90GB)采用BWA+GATK(HaplotypeCaller)的FPGA加速計算germline突變檢測，耗時可達6小時以內。
腫瘤樣本Case-control樣本變異檢測
支持GATK v3.8和GATK v4.0.6版本的Mutect2模式FPGA異構加速，提高Somatic突變檢測運行效率，一致率高達99.5%。
群體基因型GVCF檢測
支持GATK v3.8和GATK v4.0.6版本的HaplotypeCaller--emitRefConfidence GVCF+GenotypeGVCFs模式FPGA異構加速，提高群體樣本基因型GVCF檢測效率，一致率高達99.5%。
