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該解決方案有何用途?

該解決方案基于開源軟件SlurmGearbox構建,快速幫助用戶在華為云云服務器上完成基因測序HPC環(huán)境的部署。Slurm是一個開源、容錯和高度可擴展的集群管理和作業(yè)調(diào)度系統(tǒng),用于大型和小型Linux集群。該方案適用于基因行業(yè)的基因測序、數(shù)據(jù)管理和集群調(diào)度等場景。

方案部署架構

該方案可以幫助您在華為云上快速搭建基于開源集群管理和作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)Slurm的基因測序HPC環(huán)境。

快速構建基因測序環(huán)境

版本:2.1.0

上次更新日期:2024年7月

來源:由華為云構建

部署:預計45分鐘

卸載:預計10分鐘

數(shù)據(jù)中心:

架構描述

架構描述

  • 創(chuàng)建三臺華為云Flexus云服務器X實例,一臺調(diào)度節(jié)點,兩臺計算節(jié)點。自動部署HPC開源調(diào)度軟件Slurm,提供基因測序HPC環(huán)境。

  • 創(chuàng)建一個彈性文件服務 SFS Turbo,為基因測序HPC環(huán)境提供共享文件存儲服務。

  • 創(chuàng)建安全組,可以保護云服務器的網(wǎng)絡安全,通過配置安全組規(guī)則,限定云服務器的訪問端口。

  • 創(chuàng)建一個彈性公網(wǎng)IP EIP并綁定在調(diào)度節(jié)點服務器上,用于用戶訪問基因測序HPC環(huán)境。

  • 在調(diào)度節(jié)點安裝Gearbox程序、配置Java環(huán)境。

  • 使用云監(jiān)控服務 CES,Gearbox程序監(jiān)測集群作業(yè)狀態(tài),計算自定義指標Workload值,上報指標到云監(jiān)控服務。

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