randfold是什么

簡(jiǎn)介

randfold是一個(gè)獨(dú)立的基因測(cè)序相關(guān)軟件,它從原始序列開(kāi)始隨機(jī)顯示其核苷酸順序。它根據(jù)改組后的序列計(jì)算推斷結(jié)構(gòu)的最小自由能(MFE),并多次重復(fù)計(jì)算以建立最小自由能(MFE)值的分布。

配置流程

1.配置編譯環(huán)境

安裝依賴(lài)。

yum install-y git

2.獲取源碼

獲取“randfold”源碼包。

cd/usr/local/
git clone https://github.com/eb00/randfold.git

3.編譯和安裝

1)編譯randfold。

cd randfold/src/squid-1.9g
./configure&&make

2)編譯randfold。

cd../
make

編譯完成后會(huì)生成可執(zhí)行文件“randfold”。

3)設(shè)置軟連接。

ln-s/usr/local/randfold/src/randfold/usr/bin/randfold

4.運(yùn)行和驗(yàn)證

執(zhí)行如下測(cè)試命令。

randfold-d let7.tfa 999

當(dāng)系統(tǒng)回顯類(lèi)似如下信息是,表示randfold執(zhí)行成功。

cel-let-7-42.90 0.001000