簡介
Oases是一個(gè)轉(zhuǎn)錄組組裝器，旨在沒有任何基因組組裝的情況下從短讀測序技術(shù)生成轉(zhuǎn)錄本。
配置流程
1.配置編譯環(huán)境
安裝相關(guān)依賴。
yum install-y git
2.獲取源碼
獲取“oases”源碼包。
cd/usr/local git clone--recursive https://github.com/dzerbino/oases
3.編譯和安裝
1）修改Makefile文件，將“/usr/local/oases/velvet/Makefile”CFLAG后面的“-m64”刪除。
修改前。
CFLAGS=-Wall-m64
修改后。
CFLAGS=-Wall
2）編譯Oases。
make-j4
編譯完成后會(huì)在oases目錄下生成可執(zhí)行程序oases。
3）設(shè)置軟連接。
ln-s/usr/local/oases/oases/usr/bin/oases
4.運(yùn)行和驗(yàn)證
查看Oases版本信息。
oases--version
回顯如下信息則表示Osaes安裝成功。
oases 0.2.09
