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新藥研發(fā)面臨設計難度大,投資大、周期長,失敗率高巨大挑戰(zhàn)

新藥研發(fā)通常投入超10億美元、周期超10年,同時成功率往往不足1/10。

藥物分子的設計和芯片的設計一樣,難度大,投資大、周期長,失敗率高。這些問題長期困擾制藥行業(yè),制藥業(yè)的發(fā)展速度無法滿足當下人類的各種健康需求,特別是新冠這樣的突發(fā)疫情,以及癌癥、海默癥等一直沒有特效藥的頑癥等,都對新藥研發(fā)非常迫切。

傳統(tǒng)的制藥模式中,藥物結構設計高度依賴專家經驗、新藥篩選失敗率高、藥企的投資回報率不斷下降等情況使得行業(yè)迫切需要變革。


華為云盤古藥物分子大模型,大幅提升藥物設計效率

華為云深度聯合中國科學院上海藥物研究所,

共同訓練了華為云盤古藥物分子大模型,賦能全流程的AI藥物設計。

  • 針對化合物表征學習的全新深度學習網絡架構

    華為云盤古藥物分子大模型首次采用不對稱條件變分自編碼器架構,自動找出化合物關鍵的分子特征指紋,極大提升了下游任務的準確性。

    華為云盤古藥物分子大模型首次采用不對稱條件變分自編碼器架構,自動找出化合物關鍵的分子特征指紋,極大提升了下游任務的準確性。

  • 進行了超大規(guī)?;衔锉碚髂P偷挠柧?/span>

    對市面上真實存在的17億個藥物分子的化學結構進行預訓練,在化學無監(jiān)督學習模式下,實現結構重構率、合法性、唯一性等指標全面優(yōu)于現有方法。

    對市面上真實存在的17億個藥物分子的化學結構進行預訓練,在化學無監(jiān)督學習模式下,實現結構重構率、合法性、唯一性等指標全面優(yōu)于現有方法。

  • 生成了擁有1億個新化合物的數據庫

    分子生成器生成了1億個創(chuàng)新的類藥物小分子篩選庫,其結構新穎性為99.68%,并且可以有效地生成理化性質相似的新化合物,為發(fā)現新藥創(chuàng)造可能性。此外,基于盤古分子優(yōu)化器,科研人員實現了對起始分子化學結構的優(yōu)化,并且能夠改善藥物分子的特性。

    分子生成器生成了1億個創(chuàng)新的類藥物小分子篩選庫,其結構新穎性為99.68%,并且可以有效地生成理化性質相似的新化合物,為發(fā)現新藥創(chuàng)造可能性。此外,基于盤古分子優(yōu)化器,科研人員實現了對起始分子化學結構的優(yōu)化,并且能夠改善藥物分子的特性。

  • 在20余項藥物發(fā)現任務上實現性能最優(yōu)(SOTA)

    在多項任務中取得了領先的預測準確度,包括化合物-靶標相互作用預測、化合物ADME/T屬性評分、化合物分子生成與優(yōu)化等,實現了一個大模型賦能藥物發(fā)現全鏈條任務。

    在多項任務中取得了領先的預測準確度,包括化合物-靶標相互作用預測、化合物ADME/T屬性評分、化合物分子生成與優(yōu)化等,實現了一個大模型賦能藥物發(fā)現全鏈條任務。

解決方案

網站應用網站應用網站應用網站應用網站應用網站應用網站應用網站應用網站應用網站應用網站應用網站應用

華為云聯合中國科學院上海藥物研究所,共同訓練了華為云盤古藥物分子大模型。依托華為云一站式醫(yī)療研發(fā)平臺EIHealth,盤古藥物分子大模型學習了17億個藥物分子的化學結構。在藥物生成方面,實現了對小分子化合物的獨特信息的深度表征、對靶點蛋白質的計算與匹配以及對新分子生化屬性的預測,從而高效生成藥物新分子;在藥物優(yōu)化方面,實現了對篩選后的先導藥進行定向優(yōu)化。

在實際應用中,華為云聯合西安交通大學第一附屬醫(yī)院,基于華為云盤古藥物分子大模型研發(fā)出全新的廣譜抗菌藥物,將先導藥的研發(fā)周期從數年縮短至一個月,華為云盤古藥物分子大模型的落地有望革命性地提升新藥的研發(fā)效率。


中科院上海藥物研究所是華為云的戰(zhàn)略合作伙伴,我們課題組聯合華為云醫(yī)療智能體團隊共同研發(fā)藥物領域最大的億級參數盤古藥 物分子大模型。針對分子結構特點,開發(fā)出業(yè)界獨有的圖 - 序列非對稱自編碼器對 17 億類藥分子結構進行預訓練。該模型在分子生成、 分子性質預測和分子結構優(yōu)化相關的 20 多個下游任務中取得了業(yè)界最優(yōu)的性能,實現全流程的 AI 輔助藥物設計,大幅縮短藥物發(fā) 現周期。相信華為云盤古藥物分子大模型未來將會為守護人類健康貢獻更多的力量。

鄭明月中科院上海藥物研究所 博導


鄭明月
中科院上海藥物研究所 博導

中科院上海藥物研究所是華為云的戰(zhàn)略合作伙伴,我們課題組聯合華為云醫(yī)療智能體團隊共同研發(fā)藥物領域最大的億級參數盤古藥 物分子大模型。針對分子結構特點,開發(fā)出業(yè)界獨有的圖 - 序列非對稱自編碼器對 17 億類藥分子結構進行預訓練。該模型在分子生成、 分子性質預測和分子結構優(yōu)化相關的 20 多個下游任務中取得了業(yè)界最優(yōu)的性能,實現全流程的 AI 輔助藥物設計,大幅縮短藥物發(fā) 現周期。相信華為云盤古藥物分子大模型未來將會為守護人類健康貢獻更多的力量。

我們團隊研究對抗細菌耐藥的新靶標新機制,在早期研 發(fā)中驗證了細菌組蛋白 Hu 可以作為對抗細菌耐藥的靶標。去年我們與華為 云醫(yī)療智能體團隊一起發(fā)布了神農新冠病毒藥物篩選平臺,有很好的合作基礎。今年在華為云盤古藥物分子大模型的幫助下,我們 快速找到針對 Hu 蛋白的活性分子,并在小鼠實驗中得到驗證。華為云盤古藥物分子模型使分子毒性降低的同時,提高了分子的抗 菌活性,助力找到了全新的廣譜抗菌藥物,先導藥研發(fā)周期從數年縮短到一個月。非常感謝華為云醫(yī)療智能體團隊的支持。 祝華為云盤古藥物分子大模型越做越強,更好地服務于企業(yè)和科研工作者。

劉冰西安交通大學 蛋白科學與噬菌體研究所所長


劉冰
西安交通大學 蛋白科學與噬菌體研究所所長

我們團隊研究對抗細菌耐藥的新靶標新機制,在早期研 發(fā)中驗證了細菌組蛋白 Hu 可以作為對抗細菌耐藥的靶標。去年我們與華為 云醫(yī)療智能體團隊一起發(fā)布了神農新冠病毒藥物篩選平臺,有很好的合作基礎。今年在華為云盤古藥物分子大模型的幫助下,我們 快速找到針對 Hu 蛋白的活性分子,并在小鼠實驗中得到驗證。華為云盤古藥物分子模型使分子毒性降低的同時,提高了分子的抗 菌活性,助力找到了全新的廣譜抗菌藥物,先導藥研發(fā)周期從數年縮短到一個月。非常感謝華為云醫(yī)療智能體團隊的支持。 祝華為云盤古藥物分子大模型越做越強,更好地服務于企業(yè)和科研工作者。